مهم ترین تفاوت بین میکرونیدلینگ و مزونیدلینگمیزان نفوذ سوزن ها به پوست است. در واقع در میکرونیدلینگ در عمق بیشتری وارد می شود و هدف اصلی آن تحریک سازی لایه های عمیق پوست است. اما مزونیدلینگ به عمق کمتری از پوست وارد می شود و سوراخ ها در لایه کم عمق ایجاد می شوند.